Банки данных для секвенирования ДНК
Банки данных секвенирования ДНК - это общедоступные хранилища, содержащие большие объемы генетической информации от различных организмов. Эти базы данных включают, среди прочего, GenBank Национального центра биотехнологической информации (NCBI), Европейскую лабораторию молекулярной биологии (EMBL) и DDBJ в Японии. Они предоставляют необходимые ресурсы исследователям по всему миру, предлагая бесплатный доступ к геномным последовательностям, белковым структурам, моделям экспрессии генов и т.д., что помогает понять биологические процессы на молекулярном уровне.
Базы данных по белкам
Базы данных о белках, такие как PDB (the Protein Data Bank), служат всеобъемлющими источниками структурной информации о белках. Структуры могут быть визуализированы с помощью различных программных средств, позволяющих получить представление о том, как эти макромолекулы взаимодействуют друг с другом и окружающей их средой. Более того, они служат ориентирами для прогнозирования структуры белка с помощью моделирования гомологии.
Хранилища данных для профилирования экспрессии генов
Наборы данных для профилирования экспрессии генов имеют решающее значение для идентификации дифференциально экспрессируемых генов при различных состояниях, таких как болезненные состояния, типы лечения или стадии развития. Примерами могут служить GEO (серия GSE), ArrayExpress и база данных CELS. Такие наборы данных позволяют ученым анализировать общесистемные изменения в активности генов, тем самым помогая им лучше понимать сложные биологические системы.
Проекты в области метагеномики
Проекты метагеномики, подобные тем, которые проводятся проектом микробиома человека (HMP) и MetaHIT, направлены на характеристику микробных сообществ, обитающих в наших телах или на поверхностях окружающей среды соответственно. Секвенируя геномы этих бактерий, мы получаем представление о разнообразии и функциях микробов, внося значительный вклад в такие области, как инфекционные заболевания, питание и даже психиатрия.
Карты биохимических путей
Такие веб-сайты, как KEGG (Киотская энциклопедия оригиналов генов и геномов), предлагают исчерпывающие карты путей, детализирующие ключевые биохимические процессы в клетках. Эти диаграммы не только иллюстрируют соответствующие этапы, но и выделяют ферменты, ответственные за катализацию реакций, предоставляя ценную информацию для усилий по открытию лекарств.
Базы данных литературы
PubMed и Google Scholar - это две популярные базы данных литературы, в которых можно найти миллионы научных статей, связанных с биологической информацией. Поиск в этих базах данных позволяет быстро найти соответствующую литературу, подтверждающую или противоречащую гипотезам, тем самым ускоряя процесс исследования.
Патентные базы данных
Патенты, поданные частными лицами или компаниями, часто раскрывают новые технологии или открытия, связанные с биологической информацией. Такие веб-сайты, как USPTO (Ведомство по патентам и товарным знакам Соединенных Штатов), позволяют осуществлять поиск патентов по ключевым словам, предоставляя потенциальные зацепки для дальнейшего расследования.
Платформы для онлайн-курсов
Платформы онлайн-курсов, такие как Coursera, Udemy и edX, предлагают курсы, преподаваемые известными профессорами из ведущих университетов по всему миру. Эти курсы охватывают разнообразные темы, начиная от базовой биологии и заканчивая продвинутой вычислительной биологией, что позволяет всем, кто заинтересован в получении дополнительной информации о биологии, делать это в удобном для них темпе.